根腐病是影響辣椒的主要病害之一，我們對于辣椒根腐病防治主要有三種方法：
一、常規(guī)農(nóng)業(yè)措施防治-換茬輪作：
我們可以通過研究病菌在土壤中生理習(xí)性的一些特點，在蔬菜地?fù)Q茬輪作耕種的時候安排上要與大白菜、甘藍(lán)、大蒜、大蔥等作物實行5年以上的輪作，是減少或杜絕辣椒根腐病發(fā)生的重要栽培條件。
二、防治隔絕病菌感染源：
針對一些大棚培育辣椒苗時的問題，一般情況，辣椒苗要自己解決，如果出現(xiàn)情況特殊需要通過購買辣椒苗，一定不可以在根腐病發(fā)病地區(qū)購買辣椒苗，從而杜絕辣椒根腐病的傳播。在大田地塊種植辣椒在發(fā)生根腐病的初期噴灑50％根腐靈可濕性粉劑或者是50%殺菌王水溶性粉劑再或者是50%多菌靈可濕性粉劑500倍液。針對發(fā)病的情況我們還可以使用50%地靈可濕性粉劑或者是50%甲基硫菌靈可濕性粉劑以及10%雙效靈水劑等我們在使用的時候要注意的是每畝地的用藥量，我們一般的話防治根腐病時用藥量是在每667平方米噴藥液50kg，每10天左右1次，連續(xù)2～3次就可以了。在辣椒摘果的前3天必須停止用藥。
三、科學(xué)管理農(nóng)田：
我們在辣椒田管理上面，要防止田塊中積水，辣椒田里一定要有挖好排水溝，防治雨天地里積水；采用壟栽，做成90cm左右的壟距，一壟栽雙行，既利于提早封壟，又利于通風(fēng)采光和田間管理；使用充分腐熟的有機(jī)肥，田里使用追肥的時候要盡量的使用配制好的復(fù)合肥母液隨澆水時澆施，或順壟撒施后澆水，防止人為管理造成辣椒根部受傷。發(fā)病田的隔離如在辣椒田里發(fā)現(xiàn)一株或幾株出現(xiàn)中午萎蔫，晚上稍恢復(fù)的情況，就應(yīng)立即拔除，帶出田外燒掉，然后用土拌石灰掩埋辣椒株附近，隨后封閉全田。