上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院是市屬的綜合性農(nóng)業(yè)科研機構(gòu)，成立于1960年。下設(shè)作物林果研究所、設(shè)施園藝研究所、食用菌研究所、生態(tài)環(huán)境保護研究所、畜牧獸醫(yī)研究所、生物技術(shù)研究所、農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量標(biāo)準與檢測技術(shù)研究所、農(nóng)業(yè)科技信息研究所、數(shù)字農(nóng)業(yè)工程與技術(shù)研究所、農(nóng)業(yè)生物基因中心等10個研究機構(gòu)， 擁有10個和部級科技創(chuàng)新平臺和成果轉(zhuǎn)化平臺，4個市級科技平臺。
全院現(xiàn)有在職職工1000余名，其中專業(yè)技術(shù)人員515人，高級專業(yè)技術(shù)職務(wù)科技人員190名，碩、博士305名，享受特殊津貼專家69名。形成了種質(zhì)創(chuàng)新和遺傳改良、設(shè)施園藝技術(shù)、生態(tài)農(nóng)業(yè)技術(shù)、農(nóng)業(yè)生物與標(biāo)準化、農(nóng)產(chǎn)品保鮮加工、高新技術(shù)農(nóng)業(yè)應(yīng)用、都市農(nóng)業(yè)理論等優(yōu)勢學(xué)科（領(lǐng)域）。與30多個國家或地區(qū)開展科技交流和合作研究。編輯出版《上海農(nóng)業(yè)學(xué)報》和《食用菌》等7種學(xué)術(shù)類、技術(shù)類刊物，重點培育生物疫苗、食（藥）用菌、種子種苗三大科技產(chǎn)業(yè)，科技服務(wù)立足上海、輻射長三角，服務(wù)全國。
“十五”以來，上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院緊緊圍繞上海建設(shè)高效生態(tài)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的目標(biāo)，堅持自主創(chuàng)新，加強學(xué)科、平臺、基地和隊伍建設(shè)，不斷提升科技創(chuàng)新能力、成果轉(zhuǎn)化應(yīng)用能力和自我發(fā)展能力。全院共承擔(dān)國家、部（市）級以上科研攻關(guān)項目443項，獲得部（市）級以上科技成果獎62項，其中，國家科技進步二等獎1項，市科技進步一等獎7項，235個農(nóng)作物新品種通過審（認）定。
展望未來，上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院將牢牢把握加快推進農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新與成果轉(zhuǎn)化應(yīng)用這兩大基本任務(wù)，圍繞著上海經(jīng)濟的健康發(fā)展與社會的和諧進步，以科技支撐并上海未來農(nóng)業(yè)的發(fā)展。